แหล่งน้ำผิวดินตามธรรมชาติ ประกอบด้วย แม่น้ำ ลำคลอง หนอง บึง น้ำตก
ในจังหวัดนครศรีธรรมราช มีแม่น้ำหลายสายที่ไหลมารวมกัน โดยแบ่งออกเป็นกลุ่มซึ่งเรียกว่า ลุ่มน้ำ ดังนี้
1) ลุ่มน้ำภาคใต้ฝั่งตะวันออก ประกอบด้วยแม่น้ำสายหลักดังนี้
1.1) ลุ่มน้ำสาขาชายฝั่งทะเลภาคใต้ฝั่งตะวันออกส่วนที่ 3 มีพื้นที่ลุ่มน้ำอยู่ในเขตจังหวัดสุราษฎร์ธานี และอำเภอท่าศาลา อำเภอสิชล อำเภอขนอม อำเภอนบพิตำ จังหวัดนครศรีธรรมราช ลุ่มน้ำสาขาชายฝั่งทะเลภาคใต้ฝั่งตะวันออกส่วนที่ 3 สามารถ แบ่งได้เป็น 2 ส่วนใหญ่ๆ คือ ส่วนที่เป็นเกาะ (เกาะสมุย เกาะพงัน และเกาะเต่า) ลุ่มน้ำในแผ่นดินใหญ่
1.2) ลุ่มน้ำสาขาคลองกลาย
1.3) ลุ่มน้ำสาขาชายฝั่งทะเลภาคใต้ฝั่งตะวันออกส่วนที่ 4 มีพื้นที่ลุ่มน้ำส่วนใหญ่อยู่ในจังหวัดนครศรีธรรมราช และบางส่วนในอำเภอห้วยยอด อำเภอรัษฎา จังหวัดตรัง และอำเภอป่าพะยอม จังหวัดพัทลุง สามารถแบ่งออกเป็น 2 พื้นที่ใหญ่ๆ คือ
1) พื้นที่ลุ่มน้ำปากพนัง
2) กลุ่มพื้นที่ลุ่มน้ำขนาดเล็กอื่น ๆ มีสภาพภูมิประเทศเป็นพื้นที่สูงทางด้าน ทิศตะวันตกและลาดเทสู่พื้นที่ราบลุ่มทางทิศตะวันออก สามารถแบ่งพื้นที่ลุ่มน้ำที่เป็น 3 ลักษณะ คือ
- พื้นที่ต้นน้ำทางด้านทิศตะวันตกบริเวณเขาหลวง ซึ่งเป็นต้นน้ำของลำน้ำ/ คลองสาขาในพื้นที่ ถัดมาเป็นพื้นที่ราบเชิงเขา
- พื้นที่ราบซึ่งจัดเป็นพื้นที่กลางน้ำ
- พื้นที่ปลายน้ำที่ติดกับทะเลด้านอ่าวไทยเป็นแนวยาวรวมทั้งบริเวณปากแม่น้ำ พื้นที่ส่วนนี้เป็นแหล่งชุมชนและพื้นที่เพาะเลี้ยงสัตว์น้ำตลอดจนป่าชายเลน กลุ่มคลองขนาดเล็กสายสั้นๆ มีต้นกำเนิดจากเขาหลวงทางทิศตะวันตกของลุ่มน้ำ ไหลลงสู่ทะเลด้านอ่าวไทยทางด้านทิศตะวันออกในเขต อำเภอท่าศาลา อำเภอพรหมคีรี และอำเภอเมือง จังหวัดนครศรีธรรมราช โดยมีคลองสาขาที่สำคัญ เช่น คลองชุมขลิง คลองท่าแพ คลองท่าดี คลองหยวด คลองเสาธง เป็นต้น
แม่น้ำสายหลักของลุ่มน้ำภาคใต้ฝั่งตะวันออก มีดังนี้
1) แม่น้ำปากพนัง
2) แม่น้ำหลวง
3) คลองปากพูน
4) คลองปากพญา – คลองปากนคร
5) คลองเสาธง
6) คลองกลาย
7) คลองท่าทน
8) คลองน้ำตกโยง
9) คลองมีน
10) คลองท่าเลา
11) คลองท่าโลน
12) คลองสังข์
2) ลุ่มน้ำชายฝั่งทะเลภาคใต้ฝั่งตะวันตก
2.1) ชายฝั่งทะเลภาคใต้ฝั่งตะวันตก ประกอบด้วยแม่น้ำสายหลัก 1 สาย คือ แม่น้ำตรัง
3) ลุ่มน้ำตาปี
4) ลุ่มน้ำทะเลสาบสงขลา
แหล่งน้ำผิวดินที่มนุษย์สร้างขึ้น
1) อ่างเก็บน้ำขนาดใหญ่
1.1) อ่างเก็บน้ำกะทูน
1.2) อ่างเก็บน้ำคลองดินแดง
1.3) อ่างเก็บน้ำห้วยน้ำใส
1.4) อ่างเก็บน้ำเสม็ดจวน
1.5) โครงการขุดคลองระบายน้ำชะอวด-แพรกเมือง
1.6) โครงการอ่างเก็บน้ำคลองสังข์